Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDE1Q9NXR1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDE1Q9NXR1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDE1Q9NXR1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms