Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDHAF2Q9NX18 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDHAF2Q9NX18 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms