Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL11Q9NVR0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL11Q9NVR0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL11Q9NVR0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms