Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM100Q9NV29 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM100Q9NV29 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms