Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
ATG3Q9NT62 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATG3Q9NT62 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATG3Q9NT62 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ATG3Q9NT62 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATG3Q9NT62 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATG3Q9NT62 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms