Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP3Q9NQ35 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP3Q9NQ35 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP3Q9NQ35 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms