Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP140LQ9H930 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP140LQ9H930 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP140LQ9H930 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms