Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3M0

KCNF1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNF1Q9H3M0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KCNF1Q9H3M0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNF1Q9H3M0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNF1Q9H3M0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNF1Q9H3M0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNF1Q9H3M0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNF1Q9H3M0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNF1Q9H3M0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms