Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHARPINQ9H0F6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SHARPINQ9H0F6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms