Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PLVAPQ9BX97 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLVAPQ9BX97 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PLVAPQ9BX97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms