Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP85Q9BW27 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP85Q9BW27 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP85Q9BW27 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP85Q9BW27 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP85Q9BW27 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms