Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MXD3Q9BW11 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MXD3Q9BW11 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MXD3Q9BW11 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
MXD3Q9BW11 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
MXD3Q9BW11 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
MXD3Q9BW11 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MXD3Q9BW11 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
MXD3Q9BW11 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MXD3Q9BW11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MXD3Q9BW11 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
MXD3Q9BW11 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MXD3Q9BW11 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MXD3Q9BW11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms