Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf16Q9BUW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf16Q9BUW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf16Q9BUW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms