Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPON2Q9BUD6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPON2Q9BUD6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPON2Q9BUD6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPON2Q9BUD6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms