Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAF11Q99590 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
SCAF11Q99590 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SCAF11Q99590 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SCAF11Q99590 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms