Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POP1Q99575 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POP1Q99575 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POP1Q99575 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POP1Q99575 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POP1Q99575 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POP1Q99575 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POP1Q99575 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POP1Q99575 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POP1Q99575 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POP1Q99575 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POP1Q99575 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POP1Q99575 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POP1Q99575 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POP1Q99575 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POP1Q99575 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POP1Q99575 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POP1Q99575 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POP1Q99575 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POP1Q99575 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POP1Q99575 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POP1Q99575 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POP1Q99575 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POP1Q99575 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POP1Q99575 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POP1Q99575 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POP1Q99575 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POP1Q99575 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POP1Q99575 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POP1Q99575 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POP1Q99575 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POP1Q99575 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POP1Q99575 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POP1Q99575 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POP1Q99575 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POP1Q99575 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POP1Q99575 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POP1Q99575 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POP1Q99575 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POP1Q99575 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POP1Q99575 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POP1Q99575 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POP1Q99575 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POP1Q99575 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POP1Q99575 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POP1Q99575 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POP1Q99575 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POP1Q99575 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POP1Q99575 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POP1Q99575 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POP1Q99575 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
POP1Q99575 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POP1Q99575 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POP1Q99575 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POP1Q99575 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POP1Q99575 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POP1Q99575 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POP1Q99575 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POP1Q99575 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POP1Q99575 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POP1Q99575 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POP1Q99575 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POP1Q99575 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POP1Q99575 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
POP1Q99575 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
POP1Q99575 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POP1Q99575 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
POP1Q99575 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POP1Q99575 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POP1Q99575 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POP1Q99575 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POP1Q99575 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POP1Q99575 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POP1Q99575 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POP1Q99575 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POP1Q99575 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POP1Q99575 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POP1Q99575 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POP1Q99575 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POP1Q99575 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POP1Q99575 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POP1Q99575 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POP1Q99575 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POP1Q99575 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POP1Q99575 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POP1Q99575 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POP1Q99575 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POP1Q99575 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POP1Q99575 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POP1Q99575 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POP1Q99575 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POP1Q99575 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POP1Q99575 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POP1Q99575 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POP1Q99575 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POP1Q99575 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POP1Q99575 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POP1Q99575 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POP1Q99575 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POP1Q99575 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms