Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERGIC2Q96RQ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERGIC2Q96RQ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERGIC2Q96RQ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERGIC2Q96RQ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ERGIC2Q96RQ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
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