Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01600Q96MT4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01600Q96MT4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms