Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf85Q96MD7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf85Q96MD7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms