Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRC1Q96M27 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRC1Q96M27 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRRC1Q96M27 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRC1Q96M27 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms