Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGAM5Q96HS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGAM5Q96HS1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGAM5Q96HS1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGAM5Q96HS1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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