Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms