Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC120Q96HB5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC120Q96HB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC120Q96HB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms