Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SHISA4Q96DD7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHISA4Q96DD7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHISA4Q96DD7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms