Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC45Q96CN5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC45Q96CN5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC45Q96CN5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC45Q96CN5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC45Q96CN5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC45Q96CN5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC45Q96CN5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms