Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM3DQ96BQ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3DQ96BQ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3DQ96BQ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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