Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARVELD3Q96A59 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARVELD3Q96A59 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms