Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIFAP3Q92845 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIFAP3Q92845 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIFAP3Q92845 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIFAP3Q92845 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms