Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC9Q92623 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC9Q92623 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms