Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3IL1Q8TBN0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IL1Q8TBN0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB3IL1Q8TBN0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms