Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD9Q8NE22 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD9Q8NE22 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms