Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC197Q8NCU1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC197Q8NCU1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC197Q8NCU1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms