Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LINC00301Q8NCQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LINC00301Q8NCQ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00301Q8NCQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00301Q8NCQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00301Q8NCQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms