Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf53Q8N6V4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf53Q8N6V4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf53Q8N6V4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf53Q8N6V4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms