Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPTNQ6XPR3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPTNQ6XPR3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPTNQ6XPR3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms