Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCIMPQ6UWF3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCIMPQ6UWF3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCIMPQ6UWF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms