Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRIP3Q6Q6R5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRIP3Q6Q6R5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRIP3Q6Q6R5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms