Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EMBQ6PCB8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EMBQ6PCB8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EMBQ6PCB8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms