Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDE2Q6IQ49 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDE2Q6IQ49 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDE2Q6IQ49 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms