Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2CLQ60I27 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2CLQ60I27 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CLQ60I27 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms