Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM104BQ5XKR9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM104BQ5XKR9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM104BQ5XKR9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM104BQ5XKR9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM104BQ5XKR9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM104BQ5XKR9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM104BQ5XKR9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM104BQ5XKR9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM104BQ5XKR9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM104BQ5XKR9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM104BQ5XKR9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM104BQ5XKR9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms