Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COLEC12Q5KU26 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COLEC12Q5KU26 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLEC12Q5KU26 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms