Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NHLRC3Q5JS37 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NHLRC3Q5JS37 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC3Q5JS37 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms