Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC44A4Q53GD3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A4Q53GD3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms