Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC23Q53EV4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC23Q53EV4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC23Q53EV4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms