Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC58Q4VC31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC58Q4VC31 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC58Q4VC31 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms