Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL38Q2WGJ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL38Q2WGJ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms