Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRF1Q16656 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NRF1Q16656 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRF1Q16656 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
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