Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC85BQ15834 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC85BQ15834 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85BQ15834 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85BQ15834 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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