Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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