Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL9A3Q14050 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
COL9A3Q14050 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL9A3Q14050 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL9A3Q14050 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL9A3Q14050 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL9A3Q14050 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL9A3Q14050 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
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